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雪雀为何喜欢青藏高原?多组学联合分析揭示其“不怕冷”基因

华大科技 华大科技BGITech 2023-10-12
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青藏高原是一个低温、缺氧、强紫外线辐射的特殊环境,在这种极端环境下,很少有生物能繁衍壮大——雪雀却是一个特例


雪雀是一类物种的统称,包含白腰雪雀、褐翅雪雀、棕颈雪雀等多个物种,在分类学上隶属于雀科。那么,雪雀是在什么时候登上了高原,它们的祖先是否具有高原环境的适应性特征?对于亲缘关系更近、基因组更相似的不同雪雀物种,是否具有相似的基因组进化路径,用类似的遗传机制去适应环境?

图1 青藏高原棕颈雪雀 Pyrgilauda ruficollis


中国科学院动物研究所联合华大基因研究团队为解答上述问题,对雪雀属三个具有代表性的物种进行了全基因组从头测序(de novo sequencing),从基因组到表型再到蛋白质的功能验证,完整地研究了雪雀的进化历史。研究成果于2021年3月22日发表在PNAS


研究团队对雀科鸟类祖先的分布海拔和体重进行了重建,发现现生雪雀的共同祖先其实已经居住在高海拔地区,也已进化出高海拔动物所具有的体重增加这一符合“伯格曼法则”的表型(伯格曼法则:指生活在寒冷地区的个体其体积、体重,一般较生活在温暖地区的个体更大)换句话说,雪雀们已经是“老青藏”了。


为了进一步弄清它们为何“不怕冷”,如何能够适应高原地区的极端环境,团队进一步研究了其基因组进化路径,并分别在雪雀祖先和现生雪雀物种中,检测出了基因组中与适应性相关的基因,发现雪雀祖先的某一特定基因受到的正选择作用,很少能够延续到现生的雪雀物种。以上结果表明,共同的祖先的遗传背景可能会限制雪雀的适应性分化,但这种限制性仅能在一定程度上发挥作用



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本周四(4月21日)19:30,我们邀请到了上述研究的第一作者华大基因科技服务中级项目负责人——陈春海老师做客直播间,解密雪雀的前世今生,与您探讨动植物基因组学项目设计思路!


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